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确定阿马西亚地区丙型肝炎病毒基因型分布情况

标题、摘要和全文为机器翻译。 英文原文

  • Cetin Kilinc1 (通讯作者)
  • Ridvan Guckan1
  • Onder Idil2 (通讯作者)
  • Yuksel Guleryuzlu3
  • Mustafa Capraz4 (通讯作者)
  • Kemal Turker Ulutas5
  1. Clinical Microbiology, Amasya University Research Hospital, Amasya, Turkey ROR
  2. Vocational School of Health Services, Amasya University, Amasya, Turkey ROR
  3. Gastroenterology, Amasya University Research Hospital, Amasya, Turkey ROR
  4. Internal Diseases, Amasya University Research Hospital, Amasya, Turkey ROR
  5. Medical Biochemistry, Kadirli State Hospital, Osmaniye, Turkey ROR

摘要

C型肝炎病毒(HCV)是全世界肝癌,硬化症和慢性肝缺乏症最常见的原因之一. 了解HCV的基因型,在治疗前有多种基因型,在临床上对组织治疗和后续工作有帮助. 对申请到我国医院治疗的慢性丙肝病人的HCV基因型进行回顾性调查,是我们研究的目标。 2010-2014年间,82名慢性丙型肝炎患者被送往阿马西亚大学萨本库奥格卢教育和研究医院微生物实验室,其抗HCV和HCV-RNA呈阳性。 Viral genotyping是使用Qiagen单步RT-PCR(德国,基根)和ABI PRISM 3730(美国,埃尔默)系统制造的,以使用实时聚合酶链反应法(Rt-PCR). 79(96.34%)患者为基因型1,2(2.42%),1为基因型2,1为(1.21%)基因型3. 最常见的亚型是基因型1b(69.51%)和基因型1a(20.73%)的排列顺序. HCV基因型1(96.34%)在我们地区的比率很高,最常见的亚型是基因型1b(69.51%).

关键词

全文

全文为机器翻译;以英文原文为准。 英文原文

导言

C型肝炎病毒是来自弗拉维韦雷达伊家族的一种壳状和单纤维的RNA病毒,是肝炎、肝硬化和肝细胞癌的最重要原因之一。 感染HCV病毒的人数达到2亿,慢性急性感染人数达到80%,构成严重威胁 (1, 2)在进行的研究中,全世界这种感染的流行率为1-5%,据报告,我国土耳其的感染率为1-2.4%。 (3, 4)。 。 。

评估已知至少有6种主要基因型和80多种亚型的HCV基因型对组织治疗和后续工作非常重要。 (5, 6)虽然基因型1,2和3在世界上很常见,但基因型4在中东和埃及很常见,基因型5在南非很常见,基因型6在远东也很常见. 我国常见抗药性很强的1b型基因 (7, 8)我们的研究旨在对HCV-RNAH感染者血样中的HCV基因型结果进行追溯评价。

学习设计

我们的研究审查了2010-2014年间送往阿马萨亚大学教育和研究医院微生物实验室的82名患者的基因型分布情况,发现HCV-RNA呈阳性。 Viral genotyping是使用Qiagen的一步RT-PCR(德国的Qiagen,hilden)和ABI PrisM 3730(美国的Perkin Elmer)系统制造的,以便使用实时聚合酶链反应(Rt-PCR)方法.

结果

我们的研究包括82名慢性肝炎c患者,其中包括33名男性(40.24%)和49名女性(59.76%)抗HCV和HCVrna阳性患者。 使用医院自动化系统和病人档案资料对23-77岁和平均年龄为57.9岁的病人的基因类型信息和流行病学数据进行了回顾性评价。

Table 1. HCV基因型和亚型的分布
表1:HCV基因型和亚型的分布

由于对这些病人的HCV基因型分布进行了检查,79(96.34%)基因型为1(57种基因型1b,17种基因型1a,4种基因型1和1种基因型1a/1b),2(2.44%)基因型为2(1种基因型2a,1种基因型2b),1(1.22%)基因型为3。 4个基因类型1的样本没有确定这些类型。 患者中最常见的亚型为1b(69.51%)和1a(20.73%)按顺序排列. 我们得到的基因型分布如下: 页:1。 。 。

讨论情况

影响HCV感染者感染的慢性化和这种慢性化感染的预后的因素很多. 这些因素中主要包括酒精的使用,患者的性别,老年,病毒的基因型,与另一种肝炎病毒同时感染和病毒负荷量. 确定治疗和治疗期间所用药剂量的主要成因是HCV的基因型。 (9–12)虽然HCV基因型1和4引起的感染的治疗时间长于基因型2和3引起的感染,但药物剂量也较高。 基因型2和3引起的感染对治疗的积极反应较高。 (11)我们感到关切的是,HCV基因型1(96.34)对治疗的抗药性较强,在我们地区研究中的比例高于我国的类似研究。 在Izmir地区,不同地区研究发现受hcv感染的1号基因型患者的隔离流行率为93.3%。(13)特拉布宗地区92.8% (14)占安塔利亚地区83.4% (15) 在凯泽里地区占62.4%。 (16)。 。 。

在我国最近的研究中指出,主要的HCV基因型是1b。 在Kayseri地区发现与HCV感染的病人隔离的1b种基因型的隔离流行率为57.6% (16)63.3%在安塔利亚地区 (15) % 63.3, 以兹米尔地区为80.2% (13) 和84.7%的梅尔辛地区 (17)我们的研究结果为69.51%,这与我国最近进行的类似研究是一致的。 基因型1b之后最常见的亚型是基因型1a(20.73%). 虽然基因型1a是安塔利亚的第二流行率 (15) (14.7%),特拉布宗语 (14) (5.3%)和伊兹米尔 (13) (12.9%) 类似我们研究的地区,基因型4被隔离为凯泽里地区的第二个 (16) (32%).

2型(1.22%)和3型(1.22%)与我们地区常见的1型(96.34)不同,很少被观察到。 据指出,HCV基因型在不同区域之间的扩散可能是由于迁移或旅行造成的。(18) 据认为,除1号基因型外的基因型种类在我们地区很普遍,其他基因型的低速率可能与我们地区不接纳移民有关。

结论

因此,在我们的研究中,Hcv基因型感染者最常见的孤立基因型是Genotype 1b(69.51%),而Genotype 1的感染表明预后更差,在我们地区发病率更高(96.34%),这使我们感到担忧。 另外,几乎所有被隔离的基因型都是基因型1,这一事实使我们对成本效益状况产生疑问。 由于在我们的研究中使用不同的分子方法以及患者人数少,阻止了客观的结果,因此涵盖许多领域并使用标准方法将更加有用.

声明

作者贡献(CRediT)
所有作者对全部 14 项 CRediT 角色贡献均等(Conceptualization, Data curation, Formal analysis, Funding acquisition, Investigation, Methodology, Project administration, Resources, Software, Supervision, Validation, Visualization, Writing – original draft, Writing – review & editing)。
资助

Funding information was not reported in the published version of this article.

利益冲突
The authors declare that no conflict of interest exists in publishing this article.
伦理批准
Ethics approval details were not reported in the published version of this article.
数据可用性
A data availability statement was not reported in the published version of this article.

参考文献 (18)

18 条参考文献中有 10 条已链接 DOI。

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如何引用本文

Kilinc C, Guckan R, Idil O, Guleryuzlu Y, Capraz M, Ulutas KT. Determining Hepatitis C virus genotype distribution of Amasya area. Ulutas Med J. 2015;1(2):41-43. doi:10.5455/umj.20150528125725

Kilinc, C., Guckan, R., Idil, O., Guleryuzlu, Y., Capraz, M., & Ulutas, K. T. (2015). Determining Hepatitis C virus genotype distribution of Amasya area. The Ulutas Medical Journal, 1(2), 41–43. https://doi.org/10.5455/umj.20150528125725

Kilinc, C. et al. (2015) 'Determining Hepatitis C virus genotype distribution of Amasya area', The Ulutas Medical Journal, 1(2), pp. 41–43. doi: 10.5455/umj.20150528125725.

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