The Ulutas Medical Journal · ISSN 2149-0430 (مطبوع), 2149-388X (إلكتروني) · https://www.ulutasmedicaljournal.com/?mno=189685
بحث أصلي · وصول مفتوح
Determining Hepatitis C virus genotype distribution of Amasya area
ترجمة آلية للعنوان والملخص والنص الكامل. الأصل الإنجليزي
- Clinical Microbiology, Amasya University Research Hospital, Amasya, Turkey ROR
- Vocational School of Health Services, Amasya University, Amasya, Turkey ROR
- Gastroenterology, Amasya University Research Hospital, Amasya, Turkey ROR
- Internal Diseases, Amasya University Research Hospital, Amasya, Turkey ROR
- Medical Biochemistry, Kadirli State Hospital, Osmaniye, Turkey ROR
الملخص
ويمثل فيروس التهاب الكبد جيم أحد أكثر الأسباب شيوعاً لسرطان الكبد، والتهاب الكبد، ونقص الكبد المزمن في جميع أنحاء العالم. ومن شأن معرفة نوع HCV المميز بالعديد من الأنواع قبل العلاج أن يكون مفيداً سريرياً في تنظيم العلاج والمتابعة. وكان الهدف من الدراسة هو التحقيق بأثر رجعي في نماذج الأشعة فوق البنفسجية في مرضى التهاب الكبد الوبائي المزمن C الذين يتقدمون إلى مستشفى لدينا. وقد أُدرجت في دراستنا نتائج 82 مريضاً من مرضى التهاب الكبد الوبائي المزمن من الفئة " جيم " الذين أُرسلوا إلى مختبر علم الأحياء المجهرية التابع لجامعة أماسيا سابونكوغلو سيرفيدين للتعليم والبحوث في الفترة من 2010 إلى 2014 مع وجود مضادات إيجابية للفيروسات الوبائية الوبائية HCV-RNA. وأُجريت عملية إبادة الأجنة باستخدام نظام " Qiagen one-step RT-PCR " (Qiagen, Hilden, Germany) و " ABI PRISM 3730 " (Perkin Elmer, USA) من أجل استخدام أسلوب " البوليميراس " في الوقت الحقيقي. ووجد أن أكثر النماذج الفرعية شيوعا هي النموذج 1 (69.51 في المائة) والنموذج 1(أ) (20.7 في المائة) حسب الترتيب. ويُنظر إلى النموذج الأولي للأشعة فوق البنفسجية (96.34 في المائة) في نسب عالية في منطقتنا، والنوع الفرعي الأكثر شيوعا هو النموذج 1 (69.51 في المائة).
الكلمات المفتاحية
النص الكامل
ترجمة آلية للنص الكامل؛ النسخة المعتمدة هي الأصل الإنجليزي. الأصل الإنجليزي
مقدمة
إن فيروس التهاب الكبد جيم، الذي هو فيروس من نوع " RNA " من أسرة فلافيفيريدا، وهو أحد أهم أسباب التهاب الكبد، والتهاب الكبد، والسرطان الكبدي. إذ يبلغ عدد المصابين بفيروس HCV 200 مليون شخص، وتشكل الإصابات المزمنة الحادة التي تصل إلى 80 في المائة تهديدا خطيرا (1, 2)- في الدراسات التي أجريت، تبلغ نسبة انتشار هذه العدوى في جميع أنحاء العالم 1.5 في المائة، وتُبلغ هذه النسبة بأنها 1-2.4 في المائة في بلدنا، تركيا. (3, 4).
ومن المهم جداً تقييم النموذج النمطي للأشعة فوق البنفسجية الذي يُعرف بأنه يحتوي على 6 نماذج رئيسية على الأقل وأكثر من 80 نموذجاً فرعياً لتنظيم العلاج والمتابعة (5, 6)- في حين أن النماذج الجينية 1 و 2 و 3 شائعة في العالم، فإن النموذج 4 شائع في الشرق الأوسط ومصر، فإن النموذج 5 من نوع الجنس شائع في جنوب أفريقيا، والنموذج 6 شائع في الشرق الأقصى. النموذج 1 (ب) الذي يتسم بقدر كبير من المقاومة للعلاج شائع في بلدنا (7, 8)وكان الهدف من الدراسة هو إجراء تقييم بأثر رجعي لنتائج الأشعة فوق البنفسجية HCV-RNA في عينات الدم الإيجابية للمرضى المصابين بأمراض فيروس نقص المناعة البشرية.
تصميم الدراسة
وقد درسنا في دراستنا توزيعاً نقدياً لـ 82 مريضاً تم إرساله إلى مختبر علم الأحياء الدقيقة التابع لمستشفى التعليم والبحث التابع لجامعة أمصايا في الفترة من 2010 إلى 2014 مع وجود إيجابيات في هذا المجال. وأُجريت عملية إبادة الأجناس باستخدام نظام " Qiagen " (Ciagen, hilden, Germany) و " ABI PRISM 3730 " (Perkin Elmer, USA) من أجل استخدام أسلوب تفاعل سلسلة البوليميراس في الوقت الحقيقي (Rt-PCR).
النتائج
وأُدرج في دراستنا ثمانين مريضاً من مرضى التهاب الكبد المزمن c يتألفان من 33 مريضاً (40.24 في المائة) من الذكور و49 مريضاً (59.76 في المائة) من النساء المصابات بمضادات فيروس نقص المناعة البشرية/متلازمة نقص المناعة المكتسب (الإيدز). وقُيِّمت المعلومات النمطية والبيانات الوبائية للمرضى الذين تتراوح أعمارهم بين 23 و77 عاماً ومتوسط العمر 57.9 عاماً على نحو رجعي باستخدام نظام التشغيل الآلي للمستشفيات والمعلومات المتعلقة بملفات المرضى.
As the HCV genotype distributions of these patients were examined, 79 (96.34%) were genotype 1 (57 genotype 1b, 17 genotype 1a, 4 genotype1 and 1 genotype 1a/1b), 2 (2.44%) were genotype 2 (1 genotype 2a, 1 genotype 2b) and 1 (1.22%) was genotype 3. ولم تحدد هذه الأنواع في 4 عينات من نوع جيني(1). ووجد أن أكثر الأنواع الفرعية شيوعا في المرضى هي 1 (69.51 في المائة) و 1 (أ) (20.7 في المائة) حسب الترتيب. التوزيع الطبقي الذي حصلنا عليه يظهر في الجدول 1.
المناقشة
وهناك العديد من العوامل التي تؤثر على التحلل المزمن للإصابة في الأشخاص المصابين بفيروس نقص المناعة البشرية وتشخيص هذه الإصابة المزمنة. ومن بين هذه العوامل الرئيسية استخدام الكحول، ونوع جنس المريض، والشيخوخة، والنوع من الفيروس، والإصابة المصاحبة لفيروس التهاب الكبد، ومقدار الحمل الفيروسي. The main factor which determines the medicine dose containing peg-interferon and ribavirin combination to be used during the treatment and treatment application period is genotype of HCV (9–12)- على الرغم من أن مدة العلاج في حالات العدوى التي يسببها النوعان 1 و 4 من نوع HCV أطول من الإصابات الناجمة عن النوعين 2 و 3، فإن الجرعة الطبية أعلى أيضا. والرد الإيجابي على العلاج أعلى في حالات الإصابة التي يتسبب فيها النموذجان 2 و 3. (11)وقد أعربنا عن قلقنا إزاء كون نموذج HCV genotype 1 (96.34) الذي يقاوم العلاج كان في نسب أعلى في الدراسة في منطقتنا من الدراسات المماثلة في بلدنا. Isolation prevalence of genotype 1 in hcv infectious patients in studies in different areas was found 93.3% in İzmir area(13)92.8 في المائة في منطقة ترابزون (14)83.4 في المائة في منطقة أنطاليا (15) و 62.4 في المائة في منطقة كايسيري (16).
وفي الدراسات الأخيرة في بلدنا، لوحظ أن النموذج المهيمن للأشعة فوق البنفسجية هو 1ب. تم العثور على نسبة انتشار العزل من نوع 1ب معزولة عن مرضى فيروس نقص المناعة البشرية/الإيدز 57.6 في المائة في منطقة كايسيري (16)63.3 في المائة في منطقة أنطاليا (15) %63.3, 80.2% in İzmir area (13) و 84.7 في المائة في منطقة ميرسين (17)وكانت نتيجة دراستنا 69.51 في المائة كانت متمشية مع دراسات حديثة مماثلة سابقة في بلدنا. وكان النوع الفرعي الأكثر شيوعا بعد النموذج 1 (ب) من النوع 1 (أ) (20.7 في المائة). على الرغم من أن النموذج 1(أ) كان الثاني في انتشار الأنطاليا (15) (14.7 في المائة) (14) (5.3 في المائة) وإزمير (13) (12.9%) areas similar to our study, genotype 4 was isolated as the second in Kayseri area (16) (32 في المائة).
ومن النادر ملاحظة النموذج 2 (1.22 في المائة) والنوع 3 (1.22 في المائة) اللذين يُنظر إليهما مختلفين عن النموذج 1 (96.34) الذي شائع في منطقتنا. وذُكر أن انتشار نماذج الأشعة فوق البنفسجية بين مختلف المناطق قد يسببه الهجرة أو السفر.(18) ورئي أن التنوع النمطي غير النوع الأول الذي هو النوع السائد في منطقتنا وانخفاض معدلات الأنواع المميزة الأخرى يمكن أن يتصل بحقيقة أن منطقتنا لا تأخذ المهاجرين.
خاتمة
As a result the most commonly isolated genotype in patients contaminated with hcv in our study which reflects the hcv genotype distribution in our area was genotype 1b (69.51%) and the fact that genotype 1, the infections of which show a worse prognosis, has a higher prevalence in our area (96.34%) made us worry. وحقيقة أن جميع الأنواع المميزة المنعزلة تقريبا كانت من النوع الأول جعلتنا نشكك في حالة كفاءة التكاليف. وبما أن استخدام أساليب جزائية مختلفة وانخفاض عدد المرضى في دراستنا حال دون تحقيق نتائج موضوعية، فإن تغطية العديد من المجالات واستخدام أساليب قياسية سيكون أكثر فائدة.
الإقرارات
- مساهمات المؤلفين (CRediT)
- ساهم جميع المؤلفين بالتساوي في جميع أدوار CRediT الأربعة عشر (Conceptualization, Data curation, Formal analysis, Funding acquisition, Investigation, Methodology, Project administration, Resources, Software, Supervision, Validation, Visualization, Writing – original draft, Writing – review & editing).
- التمويل
-
Funding information was not reported in the published version of this article.
- تضارب المصالح
- The authors declare that no conflict of interest exists in publishing this article.
- الموافقة الأخلاقية
- Ethics approval details were not reported in the published version of this article.
- إتاحة البيانات
- A data availability statement was not reported in the published version of this article.
المراجع (18)
10 من أصل 18 مرجعًا مرتبطة بمعرّف DOI.
- Manns MP, McHutchison JG, Gordon SC, et al. Peginterferon alpha- 2b plus ribavirin compared with interferon alpha-2b plus ribavirin for initial treatment of chronic hepatitis C: a randomised trial. Lancet 2001; 358: 958-65. Çetin KILINÇ et al. Hepatitis C Virus Genotype in Amasya Area DOI Crossref PubMed Google Scholar
- Koff RS. Hepatitis C. In: Gorbach SL, Bartlett JG, Blacklow NR, eds. Infectious Diseases. 3rd ed. Philadelphia: Lippincott Williams, 2004: 779-784. PubMed Google Scholar
- Nurdan Tozun, Osman C. Ozdogan, Yilmaz Cakaloglu, Ramazan Idilman, Zeki Karasu, Ulus S. Akarca,et al. A Nationwide prevalence study and risk factors for hepatitis A, B, C and D infections in Turkey. Hepatology. 2010; 52(1); 697. PubMed Google Scholar
- Dincer D. Hepatit C Epidemiyolojisi ve Patogenezi. Turkiye Klinikleri Gastroenterohepatol Topics. 2010; 3(1): 77-80. PubMed Google Scholar
- Nakano I, Fukuda Y, Katano Y, et al. Interferon responsiveness in patients infected with hepatitis C virus 1b differs depending on viral subtype. Gut 2001; 49: 263-7. DOI Crossref PubMed Google Scholar
- Ural O, Arslan U, Fındık D. Konya bölgesinde hepatit C virusu genotip dağılımı. İnfeksiyon Derg 2007; 21: 175-81. PubMed Google Scholar
- Türkoğlu S. Hepatit C virüsü: Viroloji ve seroloji. Viral Hepatit 2003. Viral Hepatitle Savaş›m Derneği 2003; 186-98. PubMed Google Scholar
- Gökahmetoðlu S, Bozdayý M, Özbakýr Ö, et al. Hepatitis C virus genotypes detected in Erciyes University. Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi 2007;37(1): 35.38. DOI Crossref PubMed Google Scholar
- Thomas DL, Lemon SM. Hepatitis C. In: Mandell GL, Bennett JE, Dolin R, editors. Principles and Practice of Infectious Diseases, 5th ed. Philadelphia: Churchill Livingstone Determination of hepatitis C virus genotype; 2000: p.1736.1760. PubMed Google Scholar
- Sherlock S, Dooley J. Hepatitis C Virus. Diseases of the Liver and Biliary System. 11th edition 2002; 305-316. DOI Crossref PubMed Google Scholar
- Jimenez-Mendez R, Uribe-Salas F, López-Guillen P, Cisneros-Garza L, Castañeda-Hernandez G. Distribution of HCV genotypes and HCV RNA viral load in different regions of Mexico. Ann Hepatol 2010; 9(1): 33-9. DOI Crossref PubMed Google Scholar
- Ramalho F, Costa A, Pires A et al: Correlation of genotypes and route of transmission with histologic activity and disease stage in chronic hepatitis C. Dig Dis Sci 2000,45:182-187. DOI Crossref PubMed Google Scholar
- Altuğlu I, Sertöz R, Aksoy A, Gürsel D, Tüzüner U, Günşar F. Possible transmission risks and genotype distribution of hepatitis C virus infection in Western Turkey. Turk J Gastroenterol 2013; 24(5): 349-55. DOI Crossref PubMed Google Scholar
- Buruk CK, Bayramoğlu G, Reis A, Kaklıkkaya N, Tosun I, Aydın F. Determination of hepatitis C virus genotypes among hepatitis C patients in Eastern Black Sea region, Turkey. Mikrobiyol Bul 2013; 47(4): 650-7. DOI Crossref PubMed Google Scholar
- Sağlık İ, Mutlu D, Öngüt G, İnan D, Öğünç D, Distribution of Hepatitis C Virus Genotypes among Patients with Chronic Hepatitis C Infection in Akdeniz University Hospital, Antalya, Turkey: A Five-Year Evaluation Mikrobiyol Bul 2014; 48(3): 429-437 PubMed Google Scholar
- Kayman T, Karakükçü Ç, Karaman A, Gözütok F. Kayseri bölgesinde hepatit C virus enfeksiyonunun genotip dağılımı.Türk Mikrobiyol Cem Derg 2012; 42(1): 21-6. PubMed Google Scholar
- Tezcan S, Ulger M, Aslan G, et al. Determination of hepatitis C virus genotype distribution in Mersin province, Turkey. Mikrobiyol Bul 2013; 47(2): 332-8. DOI Crossref PubMed Google Scholar
- Noorali S, Pace DG, Bagasra O. Of lives and livers: emerging responses to the hepatitis C virus. J Infect Dev Ctries 2011; 5(1): 1-17. DOI Crossref PubMed Google Scholar
اقرأ النص الكامل
افتح ملف PDF هنا
جارٍ تحميل ملف PDF…
إذا لم يظهر ملف PDF هنا، استخدم زر التنزيل أعلاه.
كيف تقتبس هذه المقالة
Kilinc C, Guckan R, Idil O, Guleryuzlu Y, Capraz M, Ulutas KT. Determining Hepatitis C virus genotype distribution of Amasya area. Ulutas Med J. 2015;1(2):41-43. doi:10.5455/umj.20150528125725
Kilinc, C., Guckan, R., Idil, O., Guleryuzlu, Y., Capraz, M., & Ulutas, K. T. (2015). Determining Hepatitis C virus genotype distribution of Amasya area. The Ulutas Medical Journal, 1(2), 41–43. https://doi.org/10.5455/umj.20150528125725
Kilinc, C. et al. (2015) 'Determining Hepatitis C virus genotype distribution of Amasya area', The Ulutas Medical Journal, 1(2), pp. 41–43. doi: 10.5455/umj.20150528125725.
